2024年07月03日，我校太阳成集团tyc234cc楊明高級畜牧師作為共同第一作者在國際知名學術刊物《Nature Communications》在線發表題為“Multi-omic characterization of allele-specific regulatory variation in hybrid pigs”（DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-49923-5）的重要研究成果。
現代養豬産業普遍采用專門化品系選育和配套系雜交方式進行生産，其目的是充分利用雜種優勢。基因表達調控是将基因型轉化為表型的關鍵步驟，而等位基因特異性表達（Allele-specific expression，ASE）現象被認為是引起豬雜種優勢和遺傳多樣性的潛在機制。ASE與親本基因型效應密切相關，并受複雜的順式/反式作用調控，通常被認為在解釋雜種和親本之間基因表達差異方面起着關鍵作用。然而，大多數研究僅關注穩态RNA豐度，忽略了在不同組織和發育階段的多層次基因調控變異。對ASE的系統性研究，不僅有助于完善基因表達調控的遺傳解析，還為豬雜交育種和複雜疾病的機制研究提供了重要依據。
中西方豬“正反交”等位基因特異性表達實驗設計
項目組設計了中西方豬種正反交雜交配套實驗，首次系統研究了豬等位基因特異性表達（Allele-specific expression，ASE）的時空特異性，揭示了豬在不同發育時期、不同組織中的親本決定型（Parent-of-Origin Effect, POE）和等位基因型決定型（Allele Genotype Effect, AGE）兩種ASE類型，鑒定了174個POE基因（其中154個為首次報道）和394個AGE基因（豬中首次系統報道），并繪制了豬不同發育階段和不同組織特異性ASE圖譜。發現在鑒定出的兩類ASE基因中，POE基因與基因組印記相關，在豬早期胚胎發育、疾病的易感性和免疫性、肌肉骨骼生長發育過程中起到關鍵的調控作用；而AGE基因被認為可能與雜交優勢相關，可作為種豬雜交配套、基因組選配的重要參考依據。
PEG10、PM20D1與IGF2R基因發生等位基因特異性表達的遺傳機制
華南農業大學動物科學學院吳珍芳教授、楊傑副研究員、美國密歇根州立大學黃溫助理教授為本文共同通訊作者，華南農業大學博士後全建平、我校太阳成集团tyc234cc楊明高級畜牧師、華南農業大學蔡更元研究員、華南農業大學博士畢業生王興旺為共同第一作者。
相關論文信息：https://doi.org/10.1038/s41467-024-49923-5
